• 实践修正的变性聚丙烯酰胺凝胶电泳程序 - [实验]

    2008-03-26

    所需试剂:

    5× TBE buffer 1000 mL: Tris 54 g27.5 g硼酸,20 mL pH 8.00.5 mol/L EDTA

    40%丙烯酰胺贮存液:称取丙烯酰胺38 g2g N,N'-亚甲基双丙烯酰胺,加蒸馏水至100 mL,室温避光保存。丙烯酰胺具强烈的神经毒性,可经皮肤吸收,称量时要戴手套和面具,一般聚合后的聚丙烯酰胺无毒,考虑到其中可能有少量没聚合的丙烯酰胺,仍需小心处理。

    10%过硫酸铵:0.4 g过硫酸胺加4 mL蒸馏水,在4 ℃可保存数周。

    6× 凝胶加样缓冲液: 95%甲酰胺,20mmol/L EDTA, 0.05%溴酚兰,0.05%二甲苯兰,4℃保存。

    TEMED(N,N,N',N'-四甲基乙二胺): 液体,使丙烯酰胺单体聚合成长链。

    固定/终止液:冰醋酸100 mL、蒸馏水900 mL

    染色液: 1L水中加入1 g AgNO3 ,使用前10min加入37%甲醛2 mL,混合后即可使用。

    显影液(使用前5h配制):1L蒸馏水中加入30g Na2CO3,冷却至4℃。使用前5 min加入37%甲醛2 mL10 mg/mL Na2S2O3 200μL

    凝胶的制备及电泳:

    1)玻璃板处理。事先确定两块玻璃板是否平整,用去污剂和清水将玻璃板洗涤干净,并用去离子水冲洗,最后用95%乙醇擦拭、干燥。

    处理小玻板:加1ml Repel-Silane(剥离硅烷)于小玻板未刻标记的一面,用特制纸巾将其均匀涂抹在整个表面。室温干燥5分钟,用纸巾沾95%乙醇擦去多余的Repel-Silane 2-3次。

    处理大玻板:加8μl Bind-Silane(亲和硅烷)于1.5ml含8μl醋酸的95%乙醇中。充分混合使清澈透亮,全部加到大玻板未刻标记的一面,用特制抹布均匀涂抹整个表面。室温5分钟使挥干并用95%乙醇清洗3—4次洗去多余的Bind-Silane。

    0.4mm的边条,涂抹适当凡士林,置于左右两侧,将短板压于其上,用夹子固定住两侧,试一下鲨鱼齿是否可顺利插入;以1×TBE熬制1%琼脂糖凝胶,吸入玻璃板底部,冷却30min后用胶带密封,用夹子固定;将玻璃板近水平倾斜放置,准备灌胶。

    2)制备凝胶。 配置50mL 6%的变性聚丙烯酰胺凝胶:加入40%丙烯酰胺7.5 mL尿素21 g/32.5ml(加热溶解)、5× TBE 10 mL,搅拌均匀后加入10%过硫酸铵225μl50μl TEMED ,混匀后立即用注射器抽取灌胶。

    3)灌胶。用注射器吸取上述溶液,排除针管内的空气,将注射器嘴插入两块玻璃板的空隙处,把溶液注如入其中,避免产生气泡。灌制后即将鲨鱼齿的平整侧插入凝胶液约0.5cm处,避免梳齿下产生气泡,用夹子夹住。让丙烯酰胺于室温下聚合1 h。聚合好的凝胶可在使用前贮放1~2 d,需用1× TBE浸湿的纸巾包住梳子及凝胶顶端,再用保鲜膜包好,贮于4℃。

    4)预电泳。胶聚合以后,将玻璃板安装在电泳仪上,当凝胶聚合完全后,拨出鲨鱼齿梳,将该梳子反过来,把有齿的一头插入凝胶中,形成加样孔,电泳槽中加入足量的1× TBE 缓冲液。小心移去梳子,用蒸馏水清洗加样孔,50 W恒功率(I=60mAU=2000V)预电泳30 min,以去除气泡。

    5)点样。把DNA样品与适量(83)凝胶加样缓冲液混合,95℃变性 5 min,立即置于冰上冷却待用,每个加样孔加5μL样品DNA

    6)电泳。50 WI=60mAU=2000V)恒功率电泳,溴酚蓝至胶的四分之三处时,终止电泳。(此期间配制固定液)

    银染检测:

    1 固定(脱色)。在托盘1中加入1 L固定/终止液,将有胶的玻璃板放入托盘中,轻摇30min直到胶全部脱色;也可将胶在溶液中浸泡过夜(不摇动)。将溶液回收待用。

    2)洗胶。在托盘2中用1 L蒸馏水洗凝胶3次,每次3 min。在将玻板取出时,让玻板竖直滴干水10-20s。(此期间配制染色液)

    3)染色。在托盘3内加入1 L染色液,将胶板放入托盘中轻摇30 min。(此期间配制显色液)

    4)洗胶。将胶浸入托盘2中,快速摇晃数秒,拿出,滴干水,立即将胶置于配制好的显色液中。注意,从将胶置于水中到将其放入显色液中,时间不超过5~10 s

    5)显影。轻摇显色液,直至胶上所有的条带都出现。

    6)定影(终止显色)。将回收的固定/终止液倒入显色液中,反应2~3 min

    7)洗胶。将胶板用蒸馏水洗2次,每次2 min

    8)干胶。室温下自然干燥。

    条带观察和记录:把胶板拍照,也可干燥后永久保存。

     





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